RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PJA1Q8NG27 643 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DEPTORQ8TB45 409 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ING5Q8WYH8 240 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KXD1Q9BQD3 176 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CDT1Q9H211 546 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.63□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 E9PMD0 336 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TBC1D4O60343 1298 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 B3GAT3O94766 335 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 POU2F2P09086 479 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SP9P0CG40 484 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CD72P21854 359 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CDC25AP30304 524 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NPTX2P47972 431 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C8orf76Q96K31 380 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 POLIQ9UNA4 740 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.62□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PROZP22891 400 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 OSTNP61366 133 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LIN9Q5TKA1 542 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.61□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 WDR27A2RRH5 827 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HIP1RO75146 1068 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SEC24AO95486 1093 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CEBPBP17676 345 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FCARP24071 287 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 GRM5P41594 1212 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 CCR2P41597 374 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 EFNA5P52803 228 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ROR1Q01973 937 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 FZD5Q13467 585 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 DCLK2Q8N568 766 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ERMNQ8TAM6 284 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 NCANO14594 1321 aa14.6□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ABLIM3O94929 683 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RHOP08100 348 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MUTP22033 750 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PEX3P56589 373 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PTGDRQ13258 359 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PPP2R5AQ15172 486 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SEZ6Q53EL9 994 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KIFAP3Q92845 792 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 RMDN1Q96DB5 314 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.59□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 F5P12259 2224 aa14.58□□□□□ -0.07
CNGA3-202ENST00000393503 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 CCDC169A6NNP5 214 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 SFI1A8K8P3 1242 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 K7ERI5 159 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 PODXLO00592 558 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 XYLBO75191 536 aa14.58□□□□□ -0.08
CNGA3-202ENST00000393503 MOSPD3O75425 235 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms