RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 H2AFVQ71UI9 128 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF410Q86VK4 478 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC47A2Q86VL8 602 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PALB2Q86YC2 1186 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR49Q8IV35 697 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 EFCAB13Q8IY85 973 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NLRP7Q8WX94 980 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CREBZFQ9NS37 354 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 INTUQ9ULD6 942 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GINS2Q9Y248 185 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLXNB2O15031 1838 aa4.65□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM170AA1A519 330 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEPT4O43236 478 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NCK2O43639 380 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SRGAP2O75044 1071 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADAMTS4O75173 837 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PALMO75781 387 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 IL18RAPO95256 599 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 MMEP08473 750 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NFICP08651 508 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CXCL8P10145 99 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GZMAP12544 262 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ELNP15502 786 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CYP11B1P15538 503 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 HOXC8P31273 242 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 PIK3CAP42336 1068 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOP2P46087 812 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 VEGFBP49765 207 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 GUCY2FP51841 1108 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 HTRA3P83110 453 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 FMO1Q01740 532 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CDR2Q01850 454 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRPC3Q13507 836 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CUL2Q13617 745 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NCOA4Q13772 614 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TUBB2AQ13885 445 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNA10Q16322 511 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 VPS36Q86VN1 386 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NME8Q8N427 588 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 UBR7Q8N806 425 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 C7orf31Q8N865 590 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CXorf38Q8TB03 319 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARHGEF26Q96DR7 871 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERO1AQ96HE7 468 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM81BQ96LP2 452 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCLT1Q96NL6 688 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ACAP3Q96P50 834 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOX5Q96PH1 765 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 OSMRQ99650 979 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARID3AQ99856 593 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TUBB2BQ9BVA1 445 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 TLR10Q9BXR5 811 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 ISCUQ9H1K1 167 aa4.64□□□□□ -1.67
SNORD66.1-201ENST00000391230 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms