RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 USP25Q9UHP3 1055 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.28□□□□□ -0.92
MT-TS1-201ENST00000387416 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 VCANP13611 3396 aa9.27□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.27□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.27□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 B3GAT3O94766 335 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 NMT1P30419 496 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RESP18Q5W5W9 173 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SFR1Q86XK3 245 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PDILTQ8N807 584 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXL18Q96ME1 805 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 FIZ1Q96SL8 496 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 STRA6Q9BX79 667 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ASB7Q9H672 318 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM206Q9H813 350 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PANK4Q9NVE7 773 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 DERAQ9Y315 318 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 NR2E1Q9Y466 385 aa9.27□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 C2CD2LO14523 706 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SYN3O14994 580 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX28O15482 410 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R37O75864 691 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 KIF4AO95239 1232 aa9.26□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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MT-TS1-201ENST00000387416 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMD5Q16401 504 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 UVSSAQ2YD98 709 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ADALQ6DHV7 355 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SHC4Q6S5L8 630 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 CEP120Q8N960 986 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 APPL2Q8NEU8 664 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA32Q96LK8 384 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MAFFQ9ULX9 164 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 BACE2Q9Y5Z0 518 aa9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A087X0B3 334 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 H7C4K7 107 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 PODXLO00592 558 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 IL18RAPO95256 599 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GCNT3O95395 438 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 MYL1P05976 194 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 SLFN14P0C7P3 912 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 EPCAMP16422 314 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 GARTP22102 1010 aa9.25□□□□□ -0.93
MT-TS1-201ENST00000387416 LRPAP1P30533 357 aa9.25□□□□□ -0.93
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