RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384161.1

RNU6-48P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 48, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-48P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-48P-201ENST00000384161 AMY1AP04745 511 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 FTH1P19P0C7X4 201 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 RAP2AP10114 183 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACRV1P26436 265 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL12RB1P42701 662 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 RABGGTBP53611 331 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATP8B2P98198 1209 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 CREMQ03060 361 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 CRHR2Q13324 411 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 FOXE3Q13461 319 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 MTM1Q13496 603 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 PGS1Q32NB8 556 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 DACT2Q5SW24 774 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 AFMIDQ63HM1 303 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 C3orf20Q8ND61 904 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 REPS2Q8NFH8 660 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 TFAP2CQ92754 450 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 HPS3Q969F9 1004 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 MVB12AQ96EY5 273 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 CEP95Q96GE4 821 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 FAM167AQ96KS9 214 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 MRI1Q9BV20 369 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 KCNH6Q9H252 994 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPON1Q9HCB6 807 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 SERPINB13Q9UIV8 391 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 XDHP47989 1333 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-48P-201ENST00000384161 ERC2O15083 957 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 TRIM24O15164 1050 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PPFIA4O75335 1185 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PEX11BO96011 259 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 DSC2Q02487 901 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL10RAQ13651 578 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 MB21D1Q8N884 522 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 IFI44Q8TCB0 444 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 STON2Q8WXE9 905 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 TMX3Q96JJ7 454 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 MRGPRX4Q96LA9 322 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 NDC1Q9BTX1 674 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 LDAHQ9H6V9 325 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PARPBPQ9NWS1 579 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 POGKQ9P215 609 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 ACTL7AQ9Y615 435 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 AP1G1O43747 822 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SCGB1D2O95969 90 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPATA31D3P0C874 917 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 HK1P19367 917 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 LPOP22079 712 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SMARCA1P28370 1054 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PCSK1P29120 753 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 ALDH1A3P47895 512 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SCNN1GP51170 649 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 XYLT1Q86Y38 959 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 MYO1HQ8N1T3 1032 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 MAGEB6Q8N7X4 407 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 KAT5Q92993 513 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 RGMAQ96B86 450 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-48P-201ENST00000384161 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms