RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366304.3

HMGB1P39-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 39, humanhuman

BASIC

Gene HMGB1P39, Length 880 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P39-201ENST00000366304 SDK1Q7Z5N4 2213 aa9.5□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ARNTLO00327 626 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SGSM2O43147 1006 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TSPAN1O60635 241 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PSMD10O75832 226 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 KIF4AO95239 1232 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 RHOP08100 348 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 POU2F2P09086 479 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ZNF806P0C7X5 589 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 AKAP5P24588 427 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CDC27P30260 824 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SOX9P48436 509 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CDC42EP1Q00587 391 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 XKR3Q5GH77 459 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 LIN9Q5TKA1 542 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 KBTBD6Q86V97 674 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 LONP2Q86WA8 852 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PIK3R5Q8WYR1 880 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 FAM3CQ92520 227 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 DNASE1L2Q92874 299 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TMEM87BQ96K49 555 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MTA3Q9BTC8 594 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 KLK14Q9P0G3 267 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 KCNH3Q9ULD8 1083 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.49□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 BPTFQ12830 3046 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TAF4O00268 1085 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 GAS7O60861 476 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 XYLBO75191 536 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CCNE1P24864 410 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MCM5P33992 734 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 VIPR2P41587 438 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 RAP1GAPP47736 663 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 DNM2P50570 870 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 FOXC1Q12948 553 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PSMD5Q16401 504 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 AMHR2Q16671 573 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 APOA5Q6Q788 366 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 VITQ6UXI7 678 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CEP57Q86XR8 500 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TMTC2Q8N394 836 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TTPALQ9BTX7 342 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 GDE1Q9NZC3 331 aa9.48□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 EML1O00423 815 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MAN2B1O00754 1011 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 B4GALT5O43286 388 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MOSPD3O75425 235 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 TADA2AO75478 443 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 EPN2O95208 641 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 GDI1P31150 447 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SFNP31947 248 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 OR1D2P34982 312 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 JAK3P52333 1124 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 RAB33AQ14088 237 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 NAB2Q15742 525 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CEP68Q76N32 757 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 RIT2Q99578 217 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 IER2Q9BTL4 223 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 BRD9Q9H8M2 597 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HMGB1P39-201ENST00000366304 ESYT2A0FGR8 921 aa9.46□□□□□ -0.9
HMGB1P39-201ENST00000366304 WDR27A2RRH5 827 aa9.46□□□□□ -0.9
HMGB1P39-201ENST00000366304 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms