RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCEAL1Q15170 157 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCTE1Q5JU00 501 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR157Q5UAW9 335 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTNL9Q6UXG8 535 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DTX2Q86UW9 622 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM43AQ8N2R8 423 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLA2G15Q8NCC3 412 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10H5Q8NGA6 315 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STK32AQ8WU08 396 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GATAD2BQ8WXI9 593 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TFAP2BQ92481 460 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF428Q96B54 188 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR24Q96S15 920 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MMS19Q96T76 1030 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTFR1LQ9H019 292 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL13Q9P2N7 655 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HEY2Q9UBP5 337 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR81Q562E7 1941 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCP11X1B4DZS4 312 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMIM22K7EJ46 135 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FCHO1O14526 889 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GIPC1O14908 333 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR182O15218 404 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFB5O43674 189 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAFO75444 373 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFC1BP0CG36 223 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CFC1P0CG37 223 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ECE1P42892 770 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PMS1P54277 932 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WNT3AP56704 352 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LSAMPQ13449 338 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WBP2NLQ6ICG8 309 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM166AQ6J272 317 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEP85Q6P2H3 762 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMC7Q7Z402 723 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADGRA1Q86SQ6 560 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RSPH3Q86UC2 560 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSH3Q8TE77 659 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF721Q8TF20 911 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASB5Q8WWX0 329 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SORCS1Q8WY21 1168 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF34Q969K3 372 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHAMP1Q96JM3 812 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CITED4Q96RK1 184 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPRC5CQ9NQ84 441 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCB10Q9NRK6 738 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLDND1Q9NY35 253 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3BP4Q9P0V3 963 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXL7Q9UJT9 491 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BPTFQ12830 3046 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL12A1Q99715 3063 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0U1RQF3 1178 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTBD18B2RXH4 712 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTSS1O43312 755 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELANEP08246 267 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DRD4P21917 467 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANOS1P23352 680 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CXADRP78310 365 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAN2A1Q16706 1144 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF343Q6P1L6 599 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXL19Q6PCT2 694 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF497Q6ZNH5 498 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADIPOR2Q86V24 386 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PJA1Q8NG27 643 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NACC2Q96BF6 587 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXL20Q96IG2 436 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WHRNQ9P202 907 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FNIP2Q9P278 1114 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGSF9Q9P2J2 1179 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DENND2AQ9ULE3 1009 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHA7Q9UN72 937 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TELO2Q9Y4R8 837 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS21Q9Y6M0 314 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.33□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms