RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 EHHADHQ08426 723 aa29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 UNC13DQ70J99 1090 aa29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 MSLNLQ96KJ4 702 aa29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 ACCSQ96QU6 501 aa29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa29.43■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
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TPGS1-201ENST00000359315 IL9P15248 144 aa29.42■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa29.42■■■□□ 2.3
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TPGS1-201ENST00000359315 TADA2AO75478 443 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 URODP06132 367 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 HOXD13P35453 343 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 SYKP43405 635 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 GLUD2P49448 558 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 ACOT2P49753 483 aa29.41■■■□□ 2.3
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM26FQ5R3K3 315 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 CHST7Q9NS84 486 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa29.41■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 BRWD1Q9NSI6 2320 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 LACTBL1A8MY62 500 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 KLRC4O43908 158 aa29.4■■■□□ 2.3
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TPGS1-201ENST00000359315 DSG1Q02413 1049 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 ALCAMQ13740 583 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 RTP2Q5QGT7 225 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA0319Q5VV43 1072 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 EXOC7Q9UPT5 735 aa29.4■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.31e-7■■■■■ 172.3
TPGS1-201ENST00000359315 B3GAT3O94766 335 aa29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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TPGS1-201ENST00000359315 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 POMGNT1Q8WZA1 660 aa29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 CBWD1Q9BRT8 395 aa29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A7Q9NVC3 462 aa29.39■■■□□ 2.3
TPGS1-201ENST00000359315 GRXCR2A6NFK2 248 aa29.38■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 I3L4J1 428 aa29.38■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 PODXLO00592 558 aa29.38■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 EPCAMP16422 314 aa29.38■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 GUCY2FP51841 1108 aa29.38■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM212AQ96EL1 285 aa29.38■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 KIF12Q96FN5 646 aa29.38■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa29.37■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 BRCC3P46736 316 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 WNT7BP56706 349 aa29.37■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.37■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A17Q8WUG5 538 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 UROC1Q96N76 676 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 APOL5Q9BWW9 433 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.37■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 USP25Q9UHP3 1055 aa29.37■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 TEX28O15482 410 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 MBTPS2O43462 519 aa29.36■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 USP41Q3LFD5 358 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 JADE1Q6IE81 842 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1841Q6NSI8 718 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD54Q6NXT1 300 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 SYCE2Q6PIF2 218 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 SCFD1Q8WVM8 642 aa29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM206Q9H813 350 aa29.36■■■□□ 2.29
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TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8JA6NMD2 632 aa29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 KMT5BQ4FZB7 885 aa29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 CEP57Q86XR8 500 aa29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 NELFCDQ8IXH7 590 aa29.35■■■□□ 2.29
TPGS1-201ENST00000359315 SMRP1Q8NCR6 262 aa29.35■■■□□ 2.29
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