RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 SEC23AQ15436 765 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ELF2Q15723 593 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ANO4Q32M45 955 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KCTD1Q719H9 257 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 LDHDQ86WU2 507 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SHISA4Q96DD7 197 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DIRC2Q96SL1 478 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 APOL5Q9BWW9 433 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SCINQ9Y6U3 715 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 EFEMP2O95967 443 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SERPINB2P05120 415 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 LPLP06858 475 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PRKCAP17252 672 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DAAM2Q86T65 1068 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ABHD8Q96I13 439 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 JMJD8Q96S16 334 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 CNTNAP1P78357 1384 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ITGB4P16144 1822 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PRSS38A1L453 326 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PRRT4C9JH25 899 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ALDH2P05091 517 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KCNA3P22001 575 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 GRK6P43250 576 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 EPHA5P54756 1037 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DDR1Q08345 913 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 TTC38Q5R3I4 469 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 OR2C3Q8N628 320 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 NUP43Q8NFH3 380 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 CGRRF1Q99675 332 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 VPS11Q9H270 941 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 POFUT1Q9H488 388 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 DPP7Q9UHL4 492 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KDRP35968 1356 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 COL15A1P39059 1388 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL20-201ENST00000358813 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CCDC154A6NI56 674 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TLR5O60602 858 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 STARD3NLO95772 234 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PNLIPP16233 465 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 DDIT3P35638 169 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ARL4AP40617 200 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CASP2P42575 452 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 LGALS4P56470 323 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CORO7P57737 925 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 GPSM2P81274 684 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 CYP4F8P98187 520 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 TNFAIP2Q03169 654 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SPIDRQ14159 915 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 KIR3DS1Q14943 382 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 EMC4Q5J8M3 183 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL20-201ENST00000358813 ADGRF1Q5T601 910 aa6.52□□□□□ -1.37
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