RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 NOTUMQ6P988 496 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.15■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CITO14578 2027 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 B4GALT4O60513 344 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CABYRO75952 493 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 LCA5LO95447 670 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC172P0C7W6 258 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PTGISQ16647 500 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 LHX8Q68G74 356 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 SERINC5Q86VE9 423 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 WNT8BQ93098 351 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TFR2Q9UP52 801 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.14■■□□□ 1.14
TRIM4-202ENST00000354241 LACTBL1A8MY62 500 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 USP8P40818 1118 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ITGA7Q13683 1181 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NCOA4Q13772 614 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ACAP3Q96P50 834 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.14■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TNNC2P02585 160 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CTSHP09668 335 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 AXLP30530 894 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP25P42331 645 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.13■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MROH7Q68CQ1 1323 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ABL1P00519 1130 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 GRM5P41594 1212 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 VAV2P52735 878 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SLC18A3Q16572 532 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 A0A087X0T9 212 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TUBB4AP04350 444 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NFICP08651 508 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 FAM228BP0C875 321 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 JADE1Q6IE81 842 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 VPS36Q86VN1 386 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.12■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 HTTP42858 3142 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 MAGEA1P43355 309 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 GNG11P61952 73 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 GCNT1Q02742 428 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRPC3Q13507 836 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC122Q5T0U0 273 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 FAM228AQ86W67 206 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SHC3Q92529 594 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 FAM81BQ96LP2 452 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 DNAI1Q9UI46 699 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NOD1Q9Y239 953 aa22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RCCD1A6NED2 376 aa22.1■■□□□ 1.13
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TRIM4-202ENST00000354241 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ASB7Q9H672 318 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 SNTG2Q9NY99 539 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRIP11Q15643 1979 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 HSPA6P17066 643 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 THPOP40225 353 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 KIF5AQ12840 1032 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 KIF18AQ8NI77 898 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 ARID3AQ99856 593 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.1■■□□□ 1.13
TRIM4-202ENST00000354241 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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