RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 F5H6K3 240 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 TTC4O95801 387 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 POTEIP0CG38 1075 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 CASP4P49662 377 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 GIT2Q14161 759 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 POTEGQ6S5H5 508 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 C4orf50Q6ZRC1 276 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 KSR1Q8IVT5 923 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 DTNBP1Q96EV8 351 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 MEIS1O00470 390 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 CYP11B2P19099 503 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 OCRLQ01968 901 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 LMNB2Q03252 620 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 DSTYKQ6XUX3 929 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
GDE1-201ENST00000353258 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MEIS2O14770 477 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 KRT36O76013 467 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ECEL1O95672 775 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RXRBP28702 533 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 LLGL1Q15334 1064 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 NDNQ99608 321 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MIPEPQ99797 713 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 THAP12O43422 761 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CREB3O43889 395 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MED24O75448 989 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PYGMP11217 842 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa17.89■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PTPN4P29074 926 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SYT11Q9BT88 431 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD62A6NC57 917 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MAGEA13PA6NCF6 341 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 FAM47DPA6NHR8 397 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 NDUFB10O96000 172 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 GH2P01242 217 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 HOXD13P35453 343 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP4P98171 946 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CDR2Q01850 454 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CYP1B1Q16678 543 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 GATA6Q92908 595 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PTPRN2Q92932 1015 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 NYAP2Q9P242 653 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ASIC3Q9UHC3 531 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MTUS1Q9ULD2 1270 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SLX4Q8IY92 1834 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RASA4BC9J798 803 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CAPN9O14815 690 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RASA4O43374 803 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SPAG7O75391 227 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 GGPS1O95749 300 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CHRNB2P17787 502 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 HHATQ5VTY9 493 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 DCAF4Q8WV16 495 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TLE6Q9H808 572 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa17.88■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 TNFAIP3P21580 790 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PSMC6P62333 389 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 KRT17Q04695 432 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PRUNE1Q86TP1 453 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 C10orf82Q8WW14 230 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 OPTNQ96CV9 577 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PWWP2AQ96N64 755 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 FAM192AQ9GZU8 254 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 LGALS13Q9UHV8 139 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PRG0 241 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 H0YIN7 160 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 CDH16O75309 829 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 POTEJP0CG39 1038 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 COMTP21964 271 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 PSMC4P43686 418 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 RHBDF2Q6PJF5 856 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 SESTD1Q86VW0 696 aa17.87■□□□□ 0.45
GDE1-201ENST00000353258 MKL1Q969V6 931 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms