RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 NAB2Q15742 525 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED8Q8IZ13 594 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF3CO14782 793 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCF3Q9NUQ8 709 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 AP3B1O00203 1094 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GSTA4O15217 222 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF677Q86XU0 584 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL9O00512 1426 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC37A4O43826 429 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ACADSBP45954 432 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ARSEP51690 589 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 56.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RUBCNQ92622 972 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9A1P19634 815 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT1E1P49888 294 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FCGRTP55899 365 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM62Q0P6H9 643 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC23AQ15436 765 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6P1Q8NGX9 317 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.25■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS2P41220 211 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf131Q5VYM1 1079 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM205AQ6ZU69 1335 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NWD1Q149M9 1564 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CYBBP04839 570 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PNPLA4P41247 253 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC23LQ6PF05 361 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC26Q8NHZ8 85 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT17Q04695 432 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ACCSLQ4AC99 568 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF180Q86T96 592 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TBX20Q9UMR3 447 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ORC6Q9Y5N6 252 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS7P49802 495 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ERGIC2Q96RQ1 377 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 IRAK4Q9NWZ3 460 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 AMACRQ9UHK6 382 aa17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC36A6NLP5 189 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 E5RI56 91 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FSCBQ5H9T9 825 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ASAP3Q8TDY4 903 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO41Q8TF61 875 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MOSPD1Q9UJG1 213 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 BRAFP15056 766 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDL1Q96EA4 605 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PI4K2BG5E9Z4 385 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX17Q15036 470 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPAQ15257 358 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 HIF1AQ16665 826 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR24Q96S15 920 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JND7 137 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP69A5D8W1 941 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PDGFRBP09619 1106 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ACAD11Q709F0 780 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ULK4Q96C45 1275 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM253P0C7T8 217 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP7P55210 303 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIN1Q05586 938 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCLQ13371 301 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms