RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 NCOA4Q13772 614 aa20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 H2AFVQ71UI9 128 aa20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 GINS2Q9Y248 185 aa20.65■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 B4GALT4O60513 344 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GPR32O75388 356 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GJA9P57773 515 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TMEM192Q8IY95 271 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CREBZFQ9NS37 354 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.64■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 A0A1B0GUA9 196 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MYADML2A6NDP7 307 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TREHO43280 583 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CLTAP09496 248 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 STAG3L1P0CL83 205 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CAP1Q01518 475 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ARID3AQ99856 593 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 KPNA6O60684 536 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 IL18RAPO95256 599 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CXCL8P10145 99 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GNASQ5JWF2 1037 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PALB2Q86YC2 1186 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 C7orf31Q8N865 590 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ACP6Q9NPH0 428 aa20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 KRT5P13647 590 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CYP11B1P15538 503 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 FGFR4P22455 802 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GALCP54803 685 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TRIM32Q13049 653 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CUL2Q13617 745 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.62■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MYH10P35580 1976 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SEPT4O43236 478 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 GNAT1P11488 350 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CHRNB2P17787 502 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 KYAT1Q16773 422 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 OSMRQ99650 979 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 SPC25Q9HBM1 224 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PALMO75781 387 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PGK1P00558 417 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PDE6CP51160 858 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TAF3Q5VWG9 929 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ADPGKQ9BRR6 497 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 RNF186Q9NXI6 227 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.61■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 LACTBL1A8MY62 500 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TADA3O75528 432 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CLSTN1O94985 981 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TNNC2P02585 160 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 RARBP10826 455 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 HOXC8P31273 242 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TRPC3Q13507 836 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 CEP112Q8N8E3 955 aa20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 MMEP08473 750 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 TMEM253P0C7T8 217 aa20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
UPP1-201ENST00000331803 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms