RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321356.8

CLK1-201, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLK1, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-201ENST00000321356 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 DCLK3Q9C098 648 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CHST7Q9NS84 486 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MCM8Q9UJA3 840 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.3□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MYPNQ86TC9 1320 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TMEM120BA0PK00 339 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 DENND3A2RUS2 1198 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CFAP73A6NFT4 308 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 WDR64B1ANS9 1081 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 C21orf2O43822 256 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.921e-16■■■□□ 18.6
CLK1-201ENST00000321356 ACSL3O95573 720 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MYBL1P10243 752 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATP5DP30049 168 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MAPK4P31152 587 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SFNP31947 248 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SLC8A1P32418 973 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SLC1A1P43005 524 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MAP3K10Q02779 954 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CENPCQ03188 943 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 GALNTL6Q49A17 601 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MSL1Q68DK7 614 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 USP37Q86T82 979 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ZNF677Q86XU0 584 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 RELL1Q8IUW5 271 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TRIM7Q9C029 511 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.29□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATP6V1G2O95670 118 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 GAS8O95995 478 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CREB1P16220 341 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SCP2P22307 547 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ITGA8P53708 1063 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KRT76Q01546 638 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SNX1Q13596 522 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MPP2Q14168 576 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 NEDD9Q14511 834 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 DLGAP5Q15398 846 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 XKR9Q5GH70 373 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ANO5Q75V66 913 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CCDC63Q8NA47 563 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 RDM1Q8NG50 284 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATL2Q8NHH9 583 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 BSNDQ8WZ55 320 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CNKSR1Q969H4 720 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 FAM212AQ96EL1 285 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TRIM11Q96F44 468 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 EURLQ9NYK6 297 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 O00370 1275 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 PLSCR1O15162 318 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATP9AO75110 1047 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 PROSCO94903 275 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 GJB6O95452 261 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ASNSP08243 561 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KRT5P13647 590 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 ATF2P15336 505 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 GARTP22102 1010 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 RRM1P23921 792 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 NCALDP61601 193 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CLDN10P78369 228 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 LRRC14Q15048 493 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 PGM5Q15124 567 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CCNG2Q16589 344 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 KYNUQ16719 465 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 MON1BQ7L1V2 547 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 FAM83AQ86UY5 434 aa9.28□□□□□ -0.92
CLK1-201ENST00000321356 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms