RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 MTRRQ9UBK8 725 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TRIP11Q15643 1979 aa21.53■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC3O43617 180 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 XYLBO75191 536 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 MAPK7Q13164 816 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 KCNK18Q7Z418 384 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CDH7Q9ULB5 785 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.52■■□□□ 1.04
CXCL3-201ENST00000296026 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 I3L4J1 428 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 BRCC3P46736 316 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ANGPT1Q15389 498 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 UVSSAQ2YD98 709 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 XKR4Q5GH76 650 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 MCTP1Q6DN14 999 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 FGF14Q92915 247 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 TCHPQ9BT92 498 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 KIF3AQ9Y496 699 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.51■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PRR23AA6NEV1 266 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SFI1A8K8P3 1242 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 MCF2P10911 925 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PARM1Q6UWI2 310 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 FGF13Q92913 245 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.5■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC16A4O15374 487 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 POU2F2P09086 479 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PROZP22891 400 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ITFG1Q8TB96 612 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SNX27Q96L92 541 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ACAP3Q96P50 834 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 TIPINQ9BVW5 301 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PODXLO00592 558 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ABLIM1O14639 778 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 GUCY2CP25092 1073 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RABEP1Q15276 862 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 RTL10Q7L3V2 364 aa21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 USP34Q70CQ2 3546 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 KCNE1P15382 129 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 GPC5P78333 572 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 STRN3Q13033 797 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 HYIQ5T013 277 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 MTSS1LQ765P7 747 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA5Q96PV4 448 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 PLIN2Q99541 437 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 CNTN3Q9P232 1028 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.47■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ROR1Q01973 937 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SPECC1Q5M775 1068 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.46■■□□□ 1.03
CXCL3-201ENST00000296026 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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