RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 GPC5P78333 572 aa23.11■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 BIRC3Q13489 604 aa23.11■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.11■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP4Q96MN2 994 aa23.11■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.11■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 H3BRB1 525 aa23.1■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 MMEP08473 750 aa23.1■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC10A3P09131 477 aa23.1■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF677Q86XU0 584 aa23.1■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 L1RE1Q9UN81 338 aa23.1■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 C17orf99Q6UX52 265 aa23.1■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 FAM187BQ17R55 369 aa23.09■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 IFNL1Q8IU54 200 aa23.09■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 OR5B17Q8NGF7 314 aa23.09■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.08■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 GJB1P08034 283 aa23.08■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.08■■□□□ 1.29
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB33Q86T24 672 aa23.08■■□□□ 1.29
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SNRNP25-201ENST00000293861 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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SNRNP25-201ENST00000293861 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.06■■□□□ 1.28
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SNRNP25-201ENST00000293861 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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SNRNP25-201ENST00000293861 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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