RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 GPR62Q9BZJ7 368 aa27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 IRAK3Q9Y616 596 aa27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 GLP2RO95838 553 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 BMP1P13497 986 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 CLCNKBP51801 687 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 POSTNQ15063 836 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 FAM26FQ5R3K3 315 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 VN1R2Q8NFZ6 395 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 FAM212AQ96EL1 285 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 B3GALT6Q96L58 329 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 STYXL1Q9Y6J8 313 aa27.39■■□□□ 1.98
PDF-201ENST00000288022 FAM189A1O60320 539 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 B3GAT3O94766 335 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ACOT2P49753 483 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 SPAG1Q07617 926 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 USP41Q3LFD5 358 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 GLIS3Q8NEA6 775 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TMEM206Q9H813 350 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CD207Q9UJ71 328 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.38■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TTC26A0AVF1 554 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 LACTBL1A8MY62 500 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 EFEMP2O95967 443 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KIF12Q96FN5 646 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CLEC1BQ9P126 229 aa27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KLRC2P26717 231 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 UPP1Q16831 310 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CEP57Q86XR8 500 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa27.36■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PODXLO00592 558 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CNPP09543 421 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ADSSP30520 456 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 DSG1Q02413 1049 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KIAA0319Q5VV43 1072 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CASP10Q92851 521 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CHST7Q9NS84 486 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 FAM50BQ9Y247 325 aa27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 LILRB3O75022 631 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KCNC3Q14003 757 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 CD302Q8IX05 232 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 MSLNLQ96KJ4 702 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 SLC39A2Q9NP94 309 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 EXOC1Q9NV70 894 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 BRWD1Q9NSI6 2320 aa27.34■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 GRXCR2A6NFK2 248 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 DLL1O00548 723 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ZNF202O95125 648 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 IL9P15248 144 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 GARTP22102 1010 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 EHHADHQ08426 723 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 KRBA2Q6ZNG9 492 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 SAAL1Q96ER3 474 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TTPALQ9BTX7 342 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 NUB1Q9Y5A7 615 aa27.33■■□□□ 1.97
PDF-201ENST00000288022 TRAPPC3O43617 180 aa27.32■■□□□ 1.96
PDF-201ENST00000288022 MYL1P05976 194 aa27.32■■□□□ 1.96
PDF-201ENST00000288022 ADH1AP07327 375 aa27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms