RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MADDQ8WXG6 1647 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ASB14A6NK59 587 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB10O96000 172 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CUL3Q13618 768 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TRADDQ15628 312 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR1Q92633 364 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 MMP19Q99542 508 aa22.28■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.166e-9■□□□□ 8.6
CCSAP-201ENST00000284617 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ANKS1AQ92625 1134 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KCNN4O15554 427 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CTDNEP1O95476 244 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 KRT33BQ14525 404 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 ISCUQ9H1K1 167 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG6O75602 509 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 USP38Q8NB14 1042 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.27■■□□□ 1.16
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF10A6NK89 507 aa22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 F5H423 210 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RAD51CO43502 376 aa22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 URGCPQ8TCY9 931 aa22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 IL10P22301 178 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 LSP1P33241 339 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFRAP16234 1089 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SLC9A1P19634 815 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 HADHAP40939 763 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PGBD4Q96DM1 585 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf72Q96LT7 481 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA4Q13772 614 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TBCCQ15814 346 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 UGP2Q16851 508 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 LONRF1Q17RB8 773 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf87Q6PH81 154 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CPA5Q8WXQ8 436 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 EGFL8Q99944 293 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ERP44Q9BS26 406 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SIK2Q9H0K1 926 aa22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RPA1P27694 616 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RBP5P82980 135 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MYBP10242 640 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD3O43242 534 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ATP9BO43861 1147 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ENTPD3O75355 529 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PDHBP11177 359 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TEX12Q9BXU0 123 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ESRRBO95718 433 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 APRTP07741 180 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RASA1P20936 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC4P56524 1084 aa22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42EP1Q00587 391 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 STX3Q13277 289 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRUQ92729 1446 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 TPI1P60174 286 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RIT2Q99578 217 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 RNF135Q8IUD6 432 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 AFG1LQ8WV93 481 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 ZIM3Q96PE6 472 aa22.24■■□□□ 1.15
CCSAP-201ENST00000284617 MRGBPQ9NV56 204 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms