RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ABHD8Q96I13 439 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K7O43318 606 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 EPHB2P29323 1055 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 AK8Q96MA6 479 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 AMACRQ9UHK6 382 aa23.32■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ZCCHC18P0CG32 403 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CALCRLQ16602 461 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 WDR72Q3MJ13 1102 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CGB2Q6NT52 195 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MPP4Q96JB8 637 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HAO1Q9UJM8 370 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 STK24Q9Y6E0 443 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KLRC4O43908 158 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MARK3P27448 753 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SERPINB3P29508 390 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RCN1Q15293 331 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 GJA10Q969M2 543 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 AP1M1Q9BXS5 423 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 PTTG2Q9NZH5 202 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 LRRC53A6NM62 1247 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TTI1O43156 1089 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ASMTLO95671 621 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TARSP26639 723 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ECE1P42892 770 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 UNC13DQ70J99 1090 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 NDUFA13Q9P0J0 144 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 EFR3BQ9Y2G0 817 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KLRC1P26715 233 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 USP11P51784 963 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MTFR1Q15390 333 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 FAM151AQ8WW52 585 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.3■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 YARSP54577 528 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HDAC4P56524 1084 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ITGA9Q13797 1035 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 CFAP157Q5JU67 520 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MFSD5Q6N075 450 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 GMCL1Q96IK5 515 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HTR3EA5X5Y0 456 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 KRIT1O00522 736 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MTTPP55157 894 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 MYBPC2Q14324 1141 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 LRRC14Q15048 493 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SPDYAQ5MJ70 313 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RRAGAQ7L523 313 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ACER1Q8TDN7 264 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ERP27Q96DN0 273 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 POTEMA6NI47 508 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 A6NJR5 290 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 SMIM23A6NLE4 172 aa23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PITX1-201ENST00000265340 EPHB6O15197 1021 aa23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms