RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ANAPC5Q9UJX4 755 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.92■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SORBS3O60504 671 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 P4HBP07237 508 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MAN1A1P33908 653 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MSH2P43246 934 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 VPS41P49754 854 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 PSEN1P49768 467 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CAV1Q03135 178 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 KRT39Q6A163 491 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 IFT74Q96LB3 600 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SLC16A4O15374 487 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 GAS8O95995 478 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CALCAP01258 141 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ADCY8P40145 1251 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ADCY1Q08828 1119 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MTFR1Q15390 333 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 DACT2Q5SW24 774 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 RNF43Q68DV7 783 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.91■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CCNB1P14635 433 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ADSSP30520 456 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 FOXN2P32314 431 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 GPC3P51654 580 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ATL2Q8NHH9 583 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SAAL1Q96ER3 474 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 KLHL14Q9P2G3 628 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 DIAPH2O60879 1101 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 CDH16O75309 829 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TAC1P20366 129 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 PEX3P56589 373 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ERICH1Q86X53 443 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 KIFAP3Q92845 792 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 FAM212AQ96EL1 285 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 ZNF570Q96NI8 536 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 NT5C1BQ96P26 610 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 EURLQ9NYK6 297 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.9■□□□□ 0.14
SYP-201ENST00000263233 SCN9AQ15858 1988 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 TMEM150BA6NC51 233 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 NPR1P16066 1061 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 PAX7P23759 505 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 RRM1P23921 792 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 STRN3Q13033 797 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ACVR2BQ13705 512 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 C9orf72Q96LT7 481 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 CSRNP1Q96S65 589 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ADAM22Q9P0K1 906 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 TMX2Q9Y320 296 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 NCKAP1LP55160 1127 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 RAB20Q9NX57 234 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.89■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 ENTPD3O75355 529 aa15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 UNC5CO95185 931 aa15.88■□□□□ 0.13
SYP-201ENST00000263233 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms