RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CROCCP3Q8IVE0 287 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 JADE3Q92613 823 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 KCTD1Q719H9 257 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 DGKHQ86XP1 1220 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 ZNF18P17022 549 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 SLC16A2P36021 539 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 DMC1Q14565 340 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 MRGBPQ9NV56 204 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 SCN3BQ9NY72 215 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 COILP38432 576 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 CHI3L2Q15782 390 aa16.88■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 RGS2P41220 211 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 A8MXQ7 604 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 TRAPPC3O43617 180 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 TMEM270Q6UE05 265 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 DDIASQ8IXT1 998 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 CCSER1Q9C0I3 900 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 F8VZ95 297 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 WEE2P0C1S8 567 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 RARGP13631 454 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 C21orf59P57076 290 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 107.2
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CTIF-201ENST00000256413 BFARQ9NZS9 450 aa16.87■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.87■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.86■□□□□ 0.29
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CTIF-201ENST00000256413 NUP93Q8N1F7 819 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 NT5C2P49902 561 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 NUDT2P50583 147 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 HERVK_113P62684 666 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.86■□□□□ 0.29
CTIF-201ENST00000256413 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.86■□□□□ 0.29
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