RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SPINDOCQ05AH6 381 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nhej1Q3KNJ2 295 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Clul1Q3ZRW6 464 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q5XFZ0 217 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 FntaQ61239 377 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pacsin1Q61644 441 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Irak1Q62406 710 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q66JV7 365 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 NrcamQ810U4 1256 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 B3glctQ8BHT6 489 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Snx17Q8BVL3 470 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc45Q8CIM1 670 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ces1fQ91WU0 561 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cyp2c50Q91X77 490 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Srgap2Q91Z67 1071 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q922R1 422 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp64Q99KE8 643 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc57Q9D1G5 239 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa12.64□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ttll8A4Q9F1 832 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn2r55G3UWZ4 781 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sclt1G5E861 688 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn2r53L7N473 806 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf703P0CL69 594 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gnrh1P13562 90 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdr2P97817 455 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 BC051142Q3V0M8 400 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 FancbQ5XJY6 703 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dsg1aQ61495 1057 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ca9Q8VHB5 437 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ergic2Q9CR89 377 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arid2E9Q7E2 1828 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hoxc8P09025 242 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gna15P30678 374 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gfpt1P47856 697 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Top1Q04750 767 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Skap1Q3UUV5 355 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc26a2Q62273 739 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 IqceQ6PCQ0 778 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Celf4Q7TSY6 486 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Psmd5Q8BJY1 504 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Taf2Q8C176 1104 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zswim4Q8C7B8 1101 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dmtf1Q8CE22 761 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vopp1Q8R1C3 172 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr1499Q8VG65 314 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prkag2Q91WG5 566 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 ThegQ9JMB1 375 aa12.63□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm3164L7N2B9 238 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm3264L7N2C5 238 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mdh1P14152 334 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Polr2fP61219 127 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tubb4bP68372 445 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ptgs2Q05769 604 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mansc4Q3UU94 337 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 FdxrQ61578 494 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PoliQ6R3M4 717 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tspan18Q80WR1 248 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Elmo3Q8BYZ7 720 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CalcbQ99MP3 130 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Adam22Q9R1V6 904 aa12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prdm12A2AJ77 365 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gucy1b3O54865 620 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Xrcc6P23475 608 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Glud1P26443 558 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ano7Q14AT5 859 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Phactr1Q2M3X8 580 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Snx19Q6P4T1 997 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tlr11Q6R5P0 926 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr23Q7TRX4 325 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmem260Q8BMD6 703 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kcnv1Q8BZN2 503 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam126bQ8C729 530 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cog3Q8CI04 820 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Olfr393Q8VGR6 312 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pcdha9Q91Y11 979 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Asb7Q91ZU0 318 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arfgap2Q99K28 520 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Spata17Q9D552 379 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dkc1Q9ESX5 509 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf354bQ9QXT9 601 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Efcab12V9GXH0 673 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 H2afzP0C0S6 128 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.3 ms