RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd209bQ8CJ91 325 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ago3Q8CJF9 860 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bud13Q8R149 637 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CarfQ8VHI4 689 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klra17Q9JMA4 273 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PollQ9QXE2 573 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r1O70410 912 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vps72Q62481 368 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hook3Q8BUK6 718 aa30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbkbp1A2A9T0 611 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IkbkbO88351 757 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EgfP01132 1217 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf113a2Q14B01 337 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem232Q5K6N0 675 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q6PD19 689 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Asic3Q6X1Y6 530 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1046Q7TR79 316 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cnksr3Q8BMA3 555 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AdigQ8R400 80 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scrn2Q8VCA8 425 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smg8Q8VE18 991 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim54Q9ERP3 366 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc26a3Q9WVC8 757 aa30.91■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ube3aO08759 870 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rad23aP54726 363 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nub1P54729 614 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plk1Q07832 603 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Has1Q61647 583 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep70Q6IQY5 616 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Frmd5Q6P5H6 517 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd300aQ6SJQ0 318 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ces1fQ91WU0 561 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clstn3Q99JH7 956 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Extl1Q9JKV7 669 aa30.9■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pate3B3GLJ3 98 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FpgsP48760 587 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbxl5Q8C2S5 690 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Defb19Q8K3I8 83 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rem2Q8VEL9 341 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1499Q8VG65 314 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Setd3Q91WC0 594 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rfx5Q9JL61 658 aa30.89■■■□□ 2.54
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr552E9Q545 317 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc12a1P55014 1095 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Muc3aQ3U5A2 218 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Upf3bQ3ULL6 472 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mpp4Q6P7F1 635 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrfn2Q80TG9 788 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akirin1Q99LF1 191 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrc5C3VPR6 1915 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttc17E9PVB5 1198 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 JchainP01592 159 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gad1P48318 593 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnq1P97414 668 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem202Q80W35 275 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmd5Q8BJY1 504 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8CCC3 530 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MesdQ9ERE7 224 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt17Q9QWL7 433 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnajb7Q9QYI8 312 aa30.88■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hhla1Q3TYV2 514 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nek10Q3UGM2 1111 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sec31aQ3UPL0 1230 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnpc3Q3UZ01 514 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P3h1Q3V1T4 739 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tom1l1Q923U0 474 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem39aQ9CYC3 486 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf354bQ9QXT9 601 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Foxe3Q9QY14 288 aa30.87■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nkx1-1G3UXB3 402 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PtgisO35074 501 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vamp7P70280 220 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema4bQ62179 823 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc45Q8CIM1 670 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map4k3Q99JP0 894 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zmat2Q9CPW7 199 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rab11fip1Q9D620 645 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PirQ9D711 290 aa30.86■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ErmardE9Q048 622 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Palb2Q3U0P1 1104 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FdxrQ61578 494 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr11Q8K1X1 1223 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc71Q9D3W5 558 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adam22Q9R1V6 904 aa30.85■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6133B2RY53 190 aa30.84■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gcom1E9PZ54 550 aa30.84■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdc25cP48967 447 aa30.84■■■□□ 2.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MyzapQ3UIJ9 466 aa30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms