RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001878.5

Hoxd12-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd12, Length 2,534 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr456B2RT27 312 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Scp2P32020 547 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Erich4Q3UNU4 136 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Anks6Q6GQX6 883 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 GmipQ6PGG2 971 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Qsox1Q8BND5 748 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Commd10Q8JZY2 202 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rpp40Q8R1F9 363 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr458Q8VF80 313 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr457Q8VGP5 313 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cul1Q9WTX6 776 aa16.3■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Myo1eE9Q634 1107 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 PtenO08586 403 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 CaluO35887 315 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ifnb1P01575 182 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ccr1P51675 355 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Palb2Q3U0P1 1104 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Kdm7aQ3UWM4 940 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cd180Q62192 661 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sema5aQ62217 1077 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Calcoco1Q8CGU1 691 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1499Q8VG65 314 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Nxnl2Q9D531 156 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cnot8Q9D8X5 292 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pex5O09012 639 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 UrosP51163 265 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rhox5P52651 210 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gdpd4Q3TT99 632 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Snx27Q3UHD6 539 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Fam189a2Q4FZH1 290 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Miga1Q4QQM5 600 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vps72Q62481 368 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dzip3Q7TPV2 1204 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 RimklbQ80WS1 387 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Llgl1Q80Y17 1036 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Efl1Q8C0D5 1127 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Lztfl1Q9JHQ5 299 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Arid2E9Q7E2 1828 aa16.29■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Usp4P35123 962 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Nub1P54729 614 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ccdc33Q3ULW6 985 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ppp1r1bQ60829 194 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ttc22Q8C159 568 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P3h4Q8K2B0 443 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Q922C1 641 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rexo2Q9D8S4 237 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 IdeQ9JHR7 1019 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm28036V9GXJ1 658 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Arhgef10Q8C033 1345 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Fbf1A2A870 1173 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ccdc152E9PX14 254 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 LipeP54310 759 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 NfiaQ02780 532 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Icam5Q60625 917 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 CalcbQ99MP3 130 aa16.28■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Akr1b10G5E895 316 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pitpnm1O35954 1243 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rad54lP70270 747 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Acsbg2Q2XU92 667 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Klra7Q60654 280 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gba2Q69ZF3 918 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mbtd1Q6P5G3 631 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Apol9bQ8C7I4 310 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ccdc186Q8C9S4 917 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Apol9aQ8VDU3 310 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Msantd4Q91YU3 345 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ivns1abpQ920Q8 642 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Eps8l2Q99K30 729 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Klc4Q9DBS5 619 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ap1g2O88512 791 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gngt1Q61012 74 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cln3Q61124 438 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ush1gQ80T11 461 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Dr1Q91WV0 176 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Q9D2Q3 444 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa16.27■□□□□ 0.2
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Birc5O70201 140 aa16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 NsfP46460 744 aa16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gpr162Q3UN16 588 aa16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Srrm3Q80WV7 648 aa16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 LgsnQ8CIX8 563 aa16.26■□□□□ 0.19
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ces1fQ91WU0 561 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.7 ms