RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MYO4	P32492	1471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TRX3	P25372	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	OAC1	P32332	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PTC1	P35182	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PEX22	P39718	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	XBP1	P40489	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MOB2	P43563	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	KEG1	P43614	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	HST4	P53688	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	DAD3	P69850	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PFA5	Q03289	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	VHS1	Q03785	461 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SWM1	Q12379	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PHO2	P07269	559 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SPO12	P17123	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YBR056W	P38081	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CTP1	P38152	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YBR053C	P38235	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SDS24	P38314	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RCK1	P38622	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CHL4	P38907	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	HAC1	P41546	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	VHT1	P53241	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	NKP2	Q06162	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RFM1	Q12192	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ORT1	Q12375	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CPR3	P25719	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	DOG2	P38773	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	DOG1	P38774	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CDC1	P40986	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	TMA23	Q03525	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SEI1	Q06058	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MCH1	Q07376	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	PEX11	Q12462	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	GCN3	P14741	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	ATG22	P25568	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	GPX2	P38143	162 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	CFD1	P40558	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YPS5	P53057	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	APS2	Q00381	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	DIC1	Q06143	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
TUL1	YKL034W	PRM4	Q12498	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	MHT1	Q12525	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	BAR1	P12630	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	COQ3	P27680	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	NDT80	P38830	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	STB1	P42845	420 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SCS7	Q03529	384 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TUL1	YKL034W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	STE4	P18851	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	PCL1	P24867	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	MRPL15	P36523	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	SAP30	P38429	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	MEP2	P41948	499 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	PMT4	P46971	762 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	MRM2	P53123	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	COG7	P53195	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	CRZ1	P53968	678 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	PFA4	Q12006	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	MDM32	Q12171	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	FRE8	Q12209	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	LYS5	P50113	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	YIP4	P53093	235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TUL1	YKL034W	FLC3	P53121	802 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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