RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

BASIC

Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CEP68Q76N32 757 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HASPINQ8TF76 798 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 GJA10Q969M2 543 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CPB2Q96IY4 423 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 LXNQ9BS40 222 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 RNF39Q9H2S5 420 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 PARP2Q9UGN5 583 aa9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
HLA-B-257ENST00000640094 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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HLA-B-257ENST00000640094 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 NPTXRO95502 500 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PROS1P07225 676 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CEBPBP17676 345 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CYP3A7P24462 503 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 AKAP5P24588 427 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CXCL12P48061 93 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 NLRP5P59047 1200 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 POU5F1BQ06416 359 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 RAB33AQ14088 237 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 LONP2Q86WA8 852 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 C4orf19Q8IY42 314 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 FAM3CQ92520 227 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 FAM20AQ96MK3 541 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 MIOSQ9NXC5 875 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 MTRRQ9UBK8 725 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 F5P12259 2224 aa9.58□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF197O14709 1029 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GDF9O60383 454 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 THP07101 528 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PSMC3P17980 439 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 OR1D2P34982 312 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 FZD5Q13467 585 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GRM2Q14416 872 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SLC5A9Q2M3M2 681 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 XKR9Q5GH70 373 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ANKS3Q6ZW76 656 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 ELMOD1Q8N336 334 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GSTCDQ8NEC7 633 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 RABGGTAQ92696 567 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 VAV3Q9UKW4 847 aa9.57□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 CDY1Q9Y6F8 540 aa9.57□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PRRG1O14668 218 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TRAPPC3O43617 180 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 DGAT1O75907 488 aa9.56□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 ELF1P32519 619 aa9.56□□□□□ -0.88
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HLA-B-257ENST00000640094 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SATB1Q01826 763 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 PTGDRQ13258 359 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 CAPSQ13938 189 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 AMHR2Q16671 573 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 GALNT17Q6IS24 598 aa9.56□□□□□ -0.88
HLA-B-257ENST00000640094 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.56□□□□□ -0.88
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