RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SPAG7O75391 227 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SNF8Q96H20 258 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 DMAC2Q9NW81 257 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 FOCADQ5VW36 1801 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 BFSP1Q12934 665 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MOGSQ13724 837 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 LONP2Q86WA8 852 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 C9orf72Q96LT7 481 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 NYXQ9GZU5 481 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD33BA6NCL7 494 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 AHCYL1O43865 530 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 GNAT1P11488 350 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 TMED2Q15363 201 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 NFIL3Q16649 462 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 CD209Q9NNX6 404 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 EURLQ9NYK6 297 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 TISP43B9A030 160 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RAB27AP51159 221 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RWDD2BP57060 319 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SLCO2A1Q92959 643 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 EMSYQ7Z589 1322 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 TCEA3O75764 348 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MTA2O94776 668 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 GAP43P17677 238 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 Q4G0T1 1027 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RASA4BC9J798 803 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RASA4O43374 803 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ITIH2P19823 946 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 TSC22D3Q99576 134 aa21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 CDH16O75309 829 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ASMTLO95671 621 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 NEFHP12036 1026 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MXRA7P84157 204 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PPP3CAQ08209 521 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SETDB1Q15047 1291 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 FSCN2O14926 492 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 EXOC3O60645 756 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SMIM24O75264 130 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 BCRP11274 1271 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RRM1P23921 792 aa21.85■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.85■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 TBX3O15119 743 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ADRA2BP18089 450 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 IL9RQ01113 521 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 SLC15A2Q16348 729 aa21.84■■□□□ 1.09
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PMS1-222ENST00000639501 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ZNF653Q96CK0 615 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 CHMP2AO43633 222 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 TPH2Q8IWU9 490 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 PHC3Q8NDX5 983 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-222ENST00000639501 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.84■■□□□ 1.09
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