RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	MS4A14	Q96JA4	679 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	RILP	Q96NA2	401 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SAR1A	Q9NR31	198 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	HSPA13	P48723	471 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	MAPK6	Q16659	721 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	PACS2	Q86VP3	889 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC125	Q86Z20	511 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SLC18A1	P54219	525 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TRABD	Q9H4I3	376 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	MTMR1	Q13613	665 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		7.06	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ENTPD3	O75355	529 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	HSPA1L	P34931	641 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	GJC1	P36383	396 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	DLGAP5	Q15398	846 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SNX24	Q9Y343	169 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ALG6	Q9Y672	507 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NAT9	Q9BTE0	207 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SPAG7	O75391	227 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CYP11B2	P19099	503 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SNX1	Q13596	522 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	KIF22	Q14807	665 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SYNE4	Q8N205	404 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NUF2	Q9BZD4	464 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	FETUB	Q9UGM5	382 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	PMM2	O15305	246 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SLC29A2	Q14542	456 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	P3H1	Q32P28	736 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	KCTD6	Q8NC69	237 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	RAPGEF5	Q92565	580 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	C8orf37	Q96NL8	207 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SORBS3	O60504	671 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TCEA3	O75764	348 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	STIL	Q15468	1287 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	GPD1L	Q8N335	351 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	TSHR	P16473	764 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		7.05	□□□□□ -1.28
ACACA-231	ENST00000614428		A6NJR5	290 aa		7.05	□□□□□ -1.28

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