RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ASMTLO95671 621 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 FSCBQ5H9T9 825 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 PLA2G4FQ68DD2 849 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.013e-6■■■■□ 22.2
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CTDP1-208ENST00000613122 GTF2H3Q13889 308 aa21.34■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.34■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 TTC26A0AVF1 554 aa21.33■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.32■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 FOXN1O15353 648 aa21.32■■□□□ 1
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CTDP1-208ENST00000613122 TEX33O43247 280 aa21.31■■□□□ 1
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CTDP1-208ENST00000613122 TBCCQ15814 346 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 HPS3Q969F9 1004 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 FAM187AA6NFU0 413 aa21.3■■□□□ 1
CTDP1-208ENST00000613122 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
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