RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM186AA6NE01 2351 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL16O15467 120 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKCBP05771 671 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LIG1P18858 919 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ID4P47928 161 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC5P78333 572 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ST3GAL1Q11201 340 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK6Q16659 721 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNG4Q8TDN1 519 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NACC1Q96RE7 527 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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CAPNS1-211ENST00000590874 GLULP15104 373 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PADI6Q6TGC4 694 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PJA1Q8NG27 643 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF13Q92913 245 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 POLIQ9UNA4 740 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ACKR2O00590 384 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRN2O75325 713 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP11B2P19099 503 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA9P31269 272 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 NAMPTP43490 491 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 DEPTORQ8TB45 409 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ITFG1Q8TB96 612 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A14Q8TBB6 771 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ADPGKQ9BRR6 497 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA4AQ9H3S1 761 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GDAQ9Y2T3 454 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 COL4A3Q01955 1670 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 SP9P0CG40 484 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 STARD6P59095 220 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GUCY1B3Q02153 619 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRA4Q5JXX5 417 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf210Q8IVY1 113 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 DCHS1Q96JQ0 3298 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF35A5YM69 484 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RPA1P27694 616 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB33AQ14088 237 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 PDXDC1Q6P996 788 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 ERMP1Q7Z2K6 904 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 POLD4Q9HCU8 107 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-211ENST00000590874 XYLBO75191 536 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 FGFR3P22607 806 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1D2P34982 312 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MTSS1LQ765P7 747 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MTRRQ9UBK8 725 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SPTBN4Q9H254 2564 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 POU2F2P09086 479 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52Z1P0C646 297 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ERMNQ8TAM6 284 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GAT3O94766 335 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCNKBP51801 687 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP2R5AQ15172 486 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF174Q15697 407 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ECM1Q16610 540 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5DC1Q5TFE4 455 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NPAS3Q8IXF0 933 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SHDQ96IW2 340 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 KXD1Q9BQD3 176 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CDY1Q9Y6F8 540 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA8A3KMH1 1905 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 NEK4P51957 841 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF7IP2Q5U623 682 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DOCK6Q96HP0 2047 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 KANSL1LA0AUZ9 987 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 I3L4J1 428 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 TKTP29401 623 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 UPP1Q16831 310 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 UVSSAQ2YD98 709 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 ING5Q8WYH8 240 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH15Q9Y2K3 1946 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNA5P52803 228 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC44A4Q53GD3 710 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA2013Q8IYS2 634 aa28.21■■■□□ 2.11
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