RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRN2O75325 713 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 VAV2P52735 878 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMP4BP1P59074 171 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KIZQ2M2Z5 673 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SCLT1Q96NL6 688 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RQJ8 604 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ERLIN2O94905 339 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 IL18RAPO95256 599 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CLTAP09496 248 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MFAP3P55082 362 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC18A3Q16572 532 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF20Q3BBV1 942 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SEZ6Q53EL9 994 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF18AQ8NI77 898 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RAET1EQ8TD07 263 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 NENFQ9UMX5 172 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP8B3O60423 1300 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 EVI5O60447 810 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 VNN1O95497 513 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DRAP01903 254 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 GCNT1Q02742 428 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PTK2Q05397 1052 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT11Q9BT88 431 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PJA2O43164 708 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 AXLP30530 894 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP27A1Q02318 531 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 ARID5AQ03989 594 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1328Q86T90 577 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RPAINQ86UA6 219 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 THNSL1Q8IYQ7 743 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 SHC3Q92529 594 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CPB2Q96IY4 423 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF5CO60282 957 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 STAG3L1P0CL83 205 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEA1P43355 309 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNA10Q16322 511 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ANK1P16157 1881 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 RCCD1A6NED2 376 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CABYRO75952 493 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 ASGR1P07306 291 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3CAP42336 1068 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TERF1P54274 439 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 BIRC3Q13489 604 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 SNX17Q15036 470 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR44Q5JSH3 913 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP120Q8N960 986 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-207ENST00000589146 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.56■■□□□ 1.52
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