RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-210	ENST00000578916	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	BRF1	Q92994	677 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	GDE1	Q9NZC3	331 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ADAM12	O43184	909 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MARCH6	O60337	910 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	TDGF1	P13385	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CCR3	P51677	355 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	RAB33A	Q14088	237 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	NTRK3	Q16288	839 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CSRP2	Q16527	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	RTL10	Q7L3V2	364 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	DNASE1L2	Q92874	299 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	FAM20A	Q96MK3	541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	LXN	Q9BS40	222 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	BRD9	Q9H8M2	597 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PATJ	Q8NI35	1801 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	SLC37A4	O43826	429 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	KIF4A	O95239	1232 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	RHO	P08100	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CPA1	P15085	419 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	IFNAR1	P17181	557 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	OR1D2	P34982	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	EPHA7	Q15375	998 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	AMHR2	Q16671	573 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	FAM3C	Q92520	227 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	NID2	Q14112	1375 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916		A0A1B0GUA9	196 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	SHISA7	A6NL88	538 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ZBTB39	O15060	712 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	B4GALT5	O43286	388 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	GDF9	O60383	454 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	TH	P07101	528 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CEBPB	P17676	345 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PTPN2	P17706	415 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CXCL12	P48061	93 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CAPS	Q13938	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	GRM2	Q14416	872 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	INF2	Q27J81	1249 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	IRF7	Q92985	503 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	RGL1	Q9NZL6	768 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CACNA1G	O43497	2377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916		M0R2N6	131 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	HR	O43593	1189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	LRG1	P02750	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	GDI1	P31150	447 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ELF1	P32519	619 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	CNR2	P34972	360 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PTPRM-210	ENST00000578916	ARL2	P36404	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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