RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVFC1P60507 584 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNA1Q09470 495 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POSTNQ15063 836 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NAB2Q15742 525 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPS3Q969F9 1004 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCF25Q9BQ70 676 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COLEC11Q9BWP8 271 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MARCH5Q9NX47 278 aa24.2■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNE1P15382 129 aa24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEZ6Q53EL9 994 aa24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EXOC1Q9NV70 894 aa24.19■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TISP43B9A030 160 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KLRC4O43908 158 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CXCL8P10145 99 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KANK3Q6NY19 840 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMC7Q7Z402 723 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VPS52Q8N1B4 723 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POMGNT1Q8WZA1 660 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBP1Q9H171 429 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THEGQ9P2T0 379 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COG5Q9UP83 839 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIP11Q15643 1979 aa24.18■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCK2O43639 380 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFSF9P41273 254 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM160A1Q05DH4 1040 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP2R3AQ06190 1150 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UROC1Q96N76 676 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TTC26A0AVF1 554 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FSD2A1L4K1 749 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CTSAP10619 480 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GARTP22102 1010 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADSSP30520 456 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HYAL1Q12794 435 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL19A1Q14993 1142 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.16■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO7AQ13402 2215 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOD2P04179 222 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADRB2P07550 413 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR29P0C7W0 189 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSMD2Q13200 908 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FUT10Q6P4F1 479 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD302Q8IX05 232 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENGASEQ8NFI3 743 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HLA-CQ95604 372 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IRAK3Q9Y616 596 aa24.15■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.46
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F8W810 466 aa24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EFEMP2O95967 443 aa24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DPYDQ12882 1025 aa24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms