RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 SKIP12755 728 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ITGA4P13612 1032 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 NCLP19338 710 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GUCY2CP25092 1073 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 AXLP30530 894 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PPP2R5AQ15172 486 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 NOMO2Q5JPE7 1267 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 Q6ZVU0 165 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DYMQ7RTS9 669 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PDILTQ8N807 584 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 STAMQ92783 540 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PGBD4Q96DM1 585 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GAD1Q99259 594 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 REEP2Q9BRK0 252 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 C2orf40Q9H1Z8 148 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 IGFLR1Q9H665 355 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RSAD1Q9HA92 442 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PARP2Q9UGN5 583 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.05□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ACKR2O00590 384 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SPINT1O43278 529 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 FGF18O76093 207 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PLS3P13797 630 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 LAG3P18627 525 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DDIT3P35638 169 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MLH1P40692 756 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RAB27AP51159 221 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 BCAR1P56945 870 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ERVFC1P60507 584 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GIT2Q14161 759 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PTPROQ16827 1216 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 FAM187BQ17R55 369 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GLB1LQ6UWU2 654 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ZBTB33Q86T24 672 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 LRRC43Q8N309 656 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MYCT1Q8N699 235 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 RABGGTAQ92696 567 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 DRC1Q96MC2 740 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ZNF558Q96NG5 402 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PLVAPQ9BX97 442 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SNTG2Q9NY99 539 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GDAQ9Y2T3 454 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.04□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 ARL5CA6NH57 179 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 MYMKA6NI61 221 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 N4BP3O15049 544 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PER2O15055 1255 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PPP6R2O75170 966 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 FAM13AO94988 1023 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 YEATS4O95619 227 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 BRD1O95696 1058 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 GALTP07902 379 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SLC11A1P49279 550 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SCNN1GP51170 649 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 EFNA5P52803 228 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 OSTNP61366 133 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 BECN1Q14457 450 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 SEZ6Q53EL9 994 aa9.03□□□□□ -0.96
LINS1-211ENST00000560941 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms