RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 SYT3Q9BQG1 590 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 METP08581 1390 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 PHLPP1O60346 1717 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN8A6NHC0 703 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 GOLIM4O00461 696 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 COL6A1P12109 1028 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 CTSSP25774 331 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 POLD1P28340 1107 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 IL10RAQ13651 578 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 LLGL1Q15334 1064 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA0753Q2KHM9 967 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 MST1LQ2TV78 715 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 NPNTQ6UXI9 565 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 DAAM2Q86T65 1068 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 DRC7Q8IY82 874 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 DPF2Q92785 391 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 KAT5Q92993 513 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 GJA10Q969M2 543 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 L1RE1Q9UN81 338 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 POLHQ9Y253 713 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.28□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.27□□□□□ -1.24
TMOD3-208ENST00000560725 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 AKR1B10O60218 316 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PRAMEF4O60810 478 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 GAAP10253 952 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 EPHB3P54753 998 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 WNT3AP56704 352 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42EP1Q00587 391 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 DSC2Q02487 901 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CD69Q07108 199 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SEMA5AQ13591 1074 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF480Q8WV37 535 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SNX33Q8WV41 574 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TNIP3Q96KP6 325 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NOX5Q96PH1 765 aa7.27□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 PTPN18Q99952 460 aa7.27□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.27□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 DAPK3O43293 454 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ARIH2O95376 493 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 HMGCRP04035 888 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MAP2K6P52564 334 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 AK2P54819 239 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SEPT2Q15019 361 aa7.26□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MORC1Q86VD1 984 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.26□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 FAM167AQ96KS9 214 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TDP1Q9NUW8 608 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MST1RQ04912 1400 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.26□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 MGEA5O60502 916 aa7.25□□□□□ -1.25
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TMOD3-208ENST00000560725 ZNF28P17035 718 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PEX2P28328 305 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 LIMS1P48059 325 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 KCNQ1P51787 676 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 GPSM2P81274 684 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 PRR31Q5SQ13 230 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RNF220Q5VTB9 566 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 KRT78Q8N1N4 520 aa7.25□□□□□ -1.25
TMOD3-208ENST00000560725 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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