RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1-218ENST00000556262 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.16■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 OGTO15294 1046 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 AKR1A1P14550 325 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 RFX1P22670 979 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TUBB4BP68371 445 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 POU5F1BQ06416 359 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 AMHR2Q16671 573 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CEP120Q8N960 986 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 SCLT1Q96NL6 688 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 MYADML2A6NDP7 307 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PSEN2P49810 448 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 OSTNP61366 133 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 THNSL1Q8IYQ7 743 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 TATDN2Q93075 761 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM212AQ96EL1 285 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 Q9Y3F1 56 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 NRCAMQ92823 1304 aa20.15■□□□□ 0.82
SDR39U1-218ENST00000556262 CYBAP13498 195 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 BIRC3Q13489 604 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 KIZQ2M2Z5 673 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ZACNQ401N2 412 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 HELQQ8TDG4 1101 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CPB2Q96IY4 423 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CGRRF1Q99675 332 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CARD6Q9BX69 1037 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 GINS2Q9Y248 185 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 KRT222Q8N1A0 295 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 NT5C1BQ96P26 610 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CDT1Q9H211 546 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.14■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 MYH10P35580 1976 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 HAS3O00219 553 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ZEB2O60315 1214 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 VNN1O95497 513 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 HLA-DRAP01903 254 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 FGFR4P22455 802 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 USP8P40818 1118 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM187BQ17R55 369 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM192Q8IY95 271 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.13■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 GPR25O00155 361 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 37.8
SDR39U1-218ENST00000556262 PJA2O43164 708 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 SP3Q02447 781 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CREBZFQ9NS37 354 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 RNF186Q9NXI6 227 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 NAGPAQ9UK23 515 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM170AA1A519 330 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CTAGE9A4FU28 777 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ATP8B1O43520 1251 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 TRPA1O75762 1119 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 PGK1P00558 417 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CYP2C9P11712 490 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 PIK3CAP42336 1068 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 MFAP3P55082 362 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 KIF22Q14807 665 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.12■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 TREHO43280 583 aa20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ADAM17P78536 824 aa20.11■□□□□ 0.81
SDR39U1-218ENST00000556262 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms