RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 FGF13Q92913 245 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-211ENST00000555855 LAMTOR5O43504 91 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 KIF4AO95239 1232 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 CTDNEP1O95476 244 aa21.45■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NACC1Q96RE7 527 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 GLULP15104 373 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 OR1D2P34982 312 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 RAB33AQ14088 237 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 TRIM29Q14134 588 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.44■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 POTEMA6NI47 508 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 FAM170BA6NMN3 283 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 BTBD18B2RXH4 712 aa21.43■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 ZNF528Q3MIS6 628 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 ITFG1Q8TB96 612 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NELL2Q99435 816 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NCAM2O15394 837 aa21.42■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 TRAPPC3O43617 180 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF292O60281 2723 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 PRKCBP05771 671 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 POU2F2P09086 479 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 MAGEA9P43362 315 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 DCLK2Q8N568 766 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 DEPTORQ8TB45 409 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.42■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 ERMNQ8TAM6 284 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 GDAQ9Y2T3 454 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.41■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 FGFR3P22607 806 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NAMPTP43490 491 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.4■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NECAB1Q8N987 351 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 IFT74Q96LB3 600 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 KXD1Q9BQD3 176 aa21.4■■□□□ 1.02
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FOXN3-211ENST00000555855 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 NCDNQ9UBB6 729 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 MTRRQ9UBK8 725 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-211ENST00000555855 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 SPTLC1O15269 473 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 MED24O75448 989 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 CYP11B2P19099 503 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 ELF1P32519 619 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 MCM7P33993 719 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-211ENST00000555855 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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