RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		A0A087X0M5	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440		A0A1B0GX30	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PLS3	P13797	630 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IFNGR1	P15260	489 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	GPR3	P46089	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KCNC1	P48547	511 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	JADE3	Q92613	823 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ALG1	Q9BT22	464 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IRAK2	O43187	625 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	B3GALT2	O43825	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	UBXN7	O94888	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CKMT1A	P12532	417 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TMF1	P82094	1093 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	POSTN	Q15063	836 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TAF5	Q15542	800 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	BROX	Q5VW32	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MGEA5	O60502	916 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	EFEMP2	O95967	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	XBP1	P17861	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SDHB	P21912	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SEPHS1	P49903	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TUB	P50607	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	TRIM29	Q14134	588 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	STARD3	Q14849	445 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MCM10	Q7L590	875 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	PHKB	Q93100	1093 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP44-208	ENST00000552440	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms