RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 ASB16Q96NS5 453 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 GIT1Q9Y2X7 761 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa12.61□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 114.2
CS-208ENST00000547298 AKAP13Q12802 2813 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 C4orf47A7E2U8 309 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CYSRT1A8MQ03 144 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 TSPAN1O60635 241 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 KIF4AO95239 1232 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PSMC3P17980 439 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 AKAP5P24588 427 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SFNP31947 248 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 JAK3P52333 1124 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 TXNDC11Q6PKC3 985 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CASC1Q6TDU7 716 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CEP57Q86XR8 500 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SMC5Q8IY18 1101 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CPB2Q96IY4 423 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 RIT2Q99578 217 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 APOL6Q9BWW8 343 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 VPS45Q9NRW7 570 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SLC12A7Q9Y666 1083 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 LAMA5O15230 3695 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 WDR27A2RRH5 827 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 EXTL3O43909 919 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 MOSPD3O75425 235 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 RPP40O75818 363 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PSMD10O75832 226 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 OR1D2P34982 312 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 VIPR2P41587 438 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SOX9P48436 509 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PXNP49023 591 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 GRIK3Q13003 919 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 AMHR2Q16671 573 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 PKN3Q6P5Z2 889 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 RTL10Q7L3V2 364 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 SGMS1Q86VZ5 419 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 MICU3Q86XE3 530 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 TMEM143Q96AN5 459 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 EDEM2Q9BV94 578 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CSRNP2Q9H175 543 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 KLK14Q9P0G3 267 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 GPSM3Q9Y4H4 160 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 ADAMTS20P59510 1910 aa12.58□□□□□ -0.39
CS-208ENST00000547298 ARHGEF37A1IGU5 675 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MICAL2O94851 1124 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CEACAM1P13688 526 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MCM5P33992 734 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NPEPPSP55786 919 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 LRRC32Q14392 662 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RDM1Q8NG50 284 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 RSPRY1Q96DX4 576 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 TEKT3Q9BXF9 490 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZMYND12Q9H0C1 365 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 MTRRQ9UBK8 725 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 VWA8A3KMH1 1905 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ESYT2A0FGR8 921 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CASTOR2A6NHX0 329 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 ZNF263O14978 683 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 GAS7O60861 476 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PTPN2P17706 415 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 FGFR3P22607 806 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 AXLP30530 894 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NUCB1Q02818 461 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 CCINQ13939 588 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NAB2Q15742 525 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 PLK5Q496M5 336 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 LRCH2Q5VUJ6 765 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-208ENST00000547298 NOTUMQ6P988 496 aa12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms