RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 CIITAP33076 1130 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 LRCH2Q5VUJ6 765 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 KBTBD6Q86V97 674 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM143Q96AN5 459 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 TEKT3Q9BXF9 490 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 EML5Q05BV3 1969 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS20P59510 1910 aa26.25■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ITPR1Q14643 2758 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 OR1D2P34982 312 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 UVSSAQ2YD98 709 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 WDR44Q5JSH3 913 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 PLA2G2CQ5R387 149 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ANO5Q75V66 913 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 WDR5BQ86VZ2 330 aa26.24■■□□□ 1.79
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PRDM4-202ENST00000547188 TCEAL4Q96EI5 215 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 GIT1Q9Y2X7 761 aa26.24■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ERLIN2O94905 339 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 VITQ6UXI7 678 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 SLC5A5Q92911 643 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 LOXL4Q96JB6 756 aa26.23■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 RIT2Q99578 217 aa26.23■■□□□ 1.79
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PRDM4-202ENST00000547188 RAP1GAPP47736 663 aa26.22■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 PXNP49023 591 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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PRDM4-202ENST00000547188 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.22■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 CASTOR2A6NHX0 329 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 EDIL3O43854 480 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 PSMC3P17980 439 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 MPLP40238 635 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 NUCB1Q02818 461 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 GRIK3Q13003 919 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 RAB33AQ14088 237 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 LRRC32Q14392 662 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 NOTUMQ6P988 496 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
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PRDM4-202ENST00000547188 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PRDM4-202ENST00000547188 CSRNP2Q9H175 543 aa26.21■■□□□ 1.79
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PRDM4-202ENST00000547188 SOX9P48436 509 aa26.2■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.2■■□□□ 1.78
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PRDM4-202ENST00000547188 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 ASB16Q96NS5 453 aa26.2■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 RPP40O75818 363 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 PTPN2P17706 415 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 RTN1Q16799 776 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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PRDM4-202ENST00000547188 APOA5Q6Q788 366 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 ZSWIM3Q96MP5 696 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 CORO1BQ9BR76 489 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 EDEM2Q9BV94 578 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 PARP2Q9UGN5 583 aa26.19■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 NCANO14594 1321 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF263O14978 683 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 PSMD10O75832 226 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 CHMLP26374 656 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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PRDM4-202ENST00000547188 CDY1Q9Y6F8 540 aa26.18■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 SLC38A8A6NNN8 435 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC192P0DO97 292 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 AXLP30530 894 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 CCR2P41597 374 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 C6orf50Q9HD87 102 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 VPS45Q9NRW7 570 aa26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 IGSF10Q6WRI0 2623 aa26.16■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 WDR27A2RRH5 827 aa26.16■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 HOXA6P31267 233 aa26.16■■□□□ 1.78
PRDM4-202ENST00000547188 TUSC3Q13454 348 aa26.16■■□□□ 1.78
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