RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545303.5

TM7SF3-217, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 541 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-217ENST00000545303 SEC23AQ15436 765 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 GNPTABQ3T906 1256 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 SV2BQ7L1I2 683 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 POF1BQ8WVV4 589 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 CRELD1Q96HD1 420 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 PLXNA3P51805 1871 aa6.85□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 DOCK5Q9H7D0 1870 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF292O60281 2723 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 B4E1Z4 1266 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 FIBPO43427 364 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 CYTH3O43739 400 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 RSPH3Q86UC2 560 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 S1PR5Q9H228 398 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.84□□□□□ -1.31
TM7SF3-217ENST00000545303 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF862O60290 1169 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 TIAF1O95411 115 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 STAG3L1P0CL83 205 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ADH5P11766 374 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 KCNA2P16389 499 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 SDSP20132 328 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 NBL1P41271 181 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 NRIP1P48552 1158 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 PTPN21Q16825 1174 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 DUSP6Q16828 381 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 DNAJB3Q8WWF6 145 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 KRT23Q9C075 422 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 TLE6Q9H808 572 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 LZTS1Q9Y250 596 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.83□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 MEIS2O14770 477 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 MAFGO15525 162 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ATP9AO75110 1047 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 CD52P31358 61 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 TROAPQ12815 778 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 PPFIA1Q13136 1202 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 GRM4Q14833 912 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 LRRC14Q15048 493 aa6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TM7SF3-217ENST00000545303 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms