RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 SNTG2Q9NY99 539 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 KLK14Q9P0G3 267 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 DMDP11532 3685 aa20.55■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 ZNF292O60281 2723 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 KIF4AO95239 1232 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 LAMP2P13473 410 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 FOSBP53539 338 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 PTGDRQ13258 359 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 UVSSAQ2YD98 709 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 B3GALT6Q96L58 329 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 TIPINQ9BVW5 301 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.54■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 FGFR3P22607 806 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 RAB33AQ14088 237 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 PALB2Q86YC2 1186 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 MYADMQ96S97 322 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 K7ERI5 159 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 SRFP11831 508 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 PSMD5Q16401 504 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 HYIQ5T013 277 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 DAW1Q8N136 415 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 DNM3Q9UQ16 869 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 KIF3AQ9Y496 699 aa20.52■□□□□ 0.88
LTBR-211ENST00000543190 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PROZP22891 400 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GRM5P41594 1212 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 NPTX2P47972 431 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 HTR4Q13639 388 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 UPP1Q16831 310 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 C8orf34Q49A92 452 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 DRC1Q96MC2 740 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MTRRQ9UBK8 725 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.51■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 H0Y858 1186 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ABLIM1O14639 778 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31D3P0C874 917 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GUCY2CP25092 1073 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MAPK7Q13164 816 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KCND2Q9NZV8 630 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.5■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SLC26A4O43511 780 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 TRAPPC3O43617 180 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KCNE1P15382 129 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KRT79Q5XKE5 535 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RABGGTAQ92696 567 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PIDD1Q9HB75 910 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.49■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.48■□□□□ 0.87
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