RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 RCCD1A6NED2 376 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 A6NJR5 290 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NOTOA8MTQ0 251 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 B8ZZF3 427 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 M0QX08 132 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SPTLC1O15269 473 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SGTAO43765 313 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SH3BP5O60239 455 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 B4GALT4O60513 344 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SNX2O60749 519 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 JRKO75564 520 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KLHL2O95198 593 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SHBGP04278 402 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OCM2P0CE71 109 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SMIM18P0DKX4 95 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CHRNB1P11230 501 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 COL6A2P12110 1019 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TTKP33981 857 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL13P35225 146 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NUDT1P36639 197 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VPS41P49754 854 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NAA20P61599 178 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 B2MP61769 119 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DPYDQ12882 1025 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDC16Q13042 620 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FLIIQ13045 1269 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MOGSQ13724 837 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM29Q14134 588 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TBCCQ15814 346 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VPS37DQ86XT2 251 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PDSS2Q86YH6 399 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CYP4X1Q8N118 509 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ELMOD1Q8N336 334 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC89Q8N998 374 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 BBOF1Q8ND07 529 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 WASF1Q92558 559 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PEX13Q92968 403 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MARVELD3Q96A59 401 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT12Q99456 494 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 USP44Q9H0E7 712 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 THAP1Q9NVV9 213 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SELENONQ9NZV5 590 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ATPIF1Q9UII2 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PNMA3Q9UL41 463 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CPDO75976 1380 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PALLDQ8WX93 1383 aa6.51□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF536O15090 1300 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLIT1O75093 1534 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 METP08581 1390 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 A0A0D9SFI3 127 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CLRN2A0PK11 232 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 POTECB2RU33 542 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RNF103O00237 685 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RASGRF2O14827 1237 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MCF2LO15068 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AQP9O43315 295 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLC26A4O43511 780 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MARCH6O60337 910 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OPHN1O60890 802 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ENTPD5O75356 428 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EGFRP00533 1210 aa6.5□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IL1BP01584 269 aa6.5□□□□□ -1.37
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