RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GPD1LQ8N335 351 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPV1Q8NER1 839 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 DEPTORQ8TB45 409 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 AGPAT1Q99943 283 aa21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CES2O00748 559 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ADCY3O60266 1144 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM253P0C7T8 217 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 DNA2P51530 1060 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 APLP1P51693 650 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN3P51790 818 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 DGKDQ16760 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TCP11Q8WWU5 503 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MS4A14Q96JA4 679 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CYP24A1Q07973 514 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TLK2Q86UE8 772 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 EHD2Q9NZN4 543 aa21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 K7ERI5 159 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF4AO95239 1232 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 FLT3LGP49771 235 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 STRN3Q13033 797 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIB2Q92519 343 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-211ENST00000539589 NCANO14594 1321 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 LIG4P49917 911 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 GPC3P51654 580 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MFAP3P55082 362 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 GPS2Q13227 327 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 METTL13Q8N6R0 699 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RFFLQ8WZ73 363 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KAT2BQ92831 832 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PBKQ96KB5 322 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF233A6NK53 670 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGRP01833 764 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CASP8Q14790 479 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX26Q7Z412 305 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF149Q8NC42 400 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNK3O14649 394 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYND10O75800 440 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 USP8P40818 1118 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKCZQ05513 592 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMA4DQ92854 862 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ST7Q9NRC1 585 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 COL1A2P08123 1366 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD62A6NC57 917 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 EXTL3O43909 919 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DAAM2Q86T65 1068 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 NT5C1BQ96P26 610 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB20Q9NX57 234 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 MSCO60682 206 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCB4P21439 1286 aa21.8■■□□□ 1.08
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