RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRK-218ENST00000525459 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRK-218ENST00000525459 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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PTPRK-218ENST00000525459 WDR49Q8IV35 697 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRK-218ENST00000525459 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRK-218ENST00000525459 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRK-218ENST00000525459 TIFAQ96CG3 184 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRK-218ENST00000525459 FAM212AQ96EL1 285 aa20.29■□□□□ 0.84
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