RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM50Q86XT4 487 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 KCNN1Q92952 543 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA33Q96N06 139 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.41□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 COL4A5P29400 1685 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 PFASO15067 1338 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 MYH10P35580 1976 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF10A6NK89 507 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 MAP2K7O14733 419 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 SOX5P35711 763 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 FNTAP49354 379 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 DLG4P78352 724 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 SEZ6Q53EL9 994 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.4□□□□□ -1.06
TRPS1-208ENST00000519076 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF263O14978 683 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FANCGO15287 622 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HOXD13P35453 343 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3CAP42336 1068 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PDE6CP51160 858 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MFAP3P55082 362 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TRPC3Q13507 836 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRT72Q14CN4 511 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 KRT39Q6A163 491 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 DAW1Q8N136 415 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 EHD2Q9NZN4 543 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PNMA3Q9UL41 463 aa8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 ANO9A1A5B4 782 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC151A5D8V7 595 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF862O60290 1169 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MMEP08473 750 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SMYD1Q8NB12 490 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RNF149Q8NC42 400 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 COG1Q8WTW3 980 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A14Q96JA4 679 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM84AQ96KN4 292 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 STK33Q9BYT3 514 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 BTBD7Q9P203 1132 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 AMFRQ9UKV5 643 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 CREB3O43889 395 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 DESP17661 470 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 MESDQ14696 234 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BRD3Q15059 726 aa8.39□□□□□ -1.07
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TRPS1-208ENST00000519076 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 RDM1Q8NG50 284 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 FAM71BQ8TC56 605 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TIPINQ9BVW5 301 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 TSKSQ9UJT2 592 aa8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TRPS1-208ENST00000519076 SNX12Q9UMY4 172 aa8.39□□□□□ -1.07
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