RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	TCF12	Q99081	682 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	AKR1B10	O60218	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHF2	O75151	1096 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ENTPD5	O75356	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBXO21	O94952	628 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ABHD2	P08910	425 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	VPS41	P49754	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	RAD23B	P54727	409 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	OXA1L	Q15070	435 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBXO41	Q8TF61	875 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	FEM1C	Q96JP0	617 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	AQP9	O43315	295 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GCAT	O75600	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CIAO1	O76071	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIF4A	O95239	1232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CLTA	P09496	248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTRB1	P17538	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	LIMK1	P53667	647 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK3	Q13188	491 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	P3H1	Q32P28	736 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	MEGF6	O75095	1541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF103	O00237	685 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLF11	O14901	512 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRM5	P41594	1212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ETV4	P43268	484 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAK1	Q13153	545 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	STK38	Q15208	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDK4	Q16654	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SLC38A9-222	ENST00000515159	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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