RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 PCSK1P29120 753 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 LIMS1P48059 325 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 POU5F1BQ06416 359 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAM15Q13444 863 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 MTM1Q13496 603 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 DAG1Q14118 895 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC174Q6PII3 467 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 REPS2Q8NFH8 660 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 SCLT1Q96NL6 688 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 MAF1Q9H063 256 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.4□□□□□ -0.9
PGGT1B-205ENST00000514178 F8W8V4 182 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 BIN1O00499 593 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 IL18RAPO95256 599 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PRDX5P30044 214 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CHKAP35790 457 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR31Q5SQ13 230 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF152Q8N8N0 203 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT11Q96G61 164 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM140Q9NV12 185 aa9.39□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A087WV62 115 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf78A6NCI8 922 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 F2RL2O00254 374 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 GASTP01350 101 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 FPR1P21462 350 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 MEOX1P50221 254 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CTXN1P60606 82 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PMS2P11Q13670 270 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PCOLCEQ15113 449 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 STON2Q8WXE9 905 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 DIRC2Q96SL1 478 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 SGPP1Q9BX95 441 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 STK32BQ9NY57 414 aa9.38□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 WNT10BO00744 389 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 FGF18O76093 207 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF28P17035 718 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 IL13P35225 146 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 KIR2DL3P43628 341 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 MRE11P49959 708 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPK10P53779 464 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM132EQ6IEE7 984 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 SUCLG2Q96I99 432 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNK12Q9HB15 430 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ACTL7AQ9Y615 435 aa9.37□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 APOL1O14791 398 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 AHSGP02765 367 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 GYPEP15421 78 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGB5P18084 799 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPN7P35236 360 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CCT6BQ92526 530 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM168AQ92567 244 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 ARL8AQ96BM9 186 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 CASS4Q9NQ75 786 aa9.36□□□□□ -0.91
PGGT1B-205ENST00000514178 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms