RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513072.1

ANKRD40-203, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD40, Length 848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-203ENST00000513072 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PASKQ96RG2 1323 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 H0YIN7 160 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 HMGCRP04035 888 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CNGA1P29973 690 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 STAT4Q14765 748 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SURF1Q15526 300 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 LILRA6Q6PI73 481 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 OLFM4Q6UX06 510 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CXorf38Q8TB03 319 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.314e-7■□□□□ 9.1
ANKRD40-203ENST00000513072 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 A0A0A6YYJ9 748 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 APOL3O95236 402 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PLATP00750 562 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 STAT5BP51692 787 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 EPHB4P54760 987 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MAP3K12Q12852 859 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PCOLCEQ15113 449 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 TBR1Q16650 682 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 DGKDQ16760 1214 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RELTQ969Z4 430 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PTPN18Q99952 460 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SLX4Q8IY92 1834 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MYPNQ86TC9 1320 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SCN7AQ01118 1682 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PRSS38A1L453 326 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 LAMTOR5O43504 91 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 KCNQ3O43525 872 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ULK1O75385 1050 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CAMTA2O94983 1202 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 LBX1P52954 281 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RRADP55042 308 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SESN3P58005 492 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PDCD1Q15116 288 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RNF151Q2KHN1 245 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MORC1Q86VD1 984 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 VWA7Q9Y334 891 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 GPR39O43194 453 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 OPHN1O60890 802 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 RAB11FIP3O75154 756 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 A1BGP04217 495 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CPEP16870 476 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MRE11P49959 708 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 NFYCQ13952 458 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 AGBL4Q5VU57 503 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 IL17REQ8NFR9 667 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SOX7Q9BT81 388 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 MTG2Q9H4K7 406 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 VTA1Q9NP79 307 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD40-203ENST00000513072 COL4A5P29400 1685 aa6.84□□□□□ -1.32
ANKRD40-203ENST00000513072 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD40-203ENST00000513072 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD40-203ENST00000513072 MATN2O00339 956 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms