RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511595.5

FAM53C-209, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 3

Gene FAM53C, Length 551 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-209	ENST00000511595	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	BPI	P17213	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	CXCR5	P32302	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	CLRN1	P58418	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	STRN3	Q13033	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595		Q6ZVL8	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	RNF180	Q86T96	592 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
FAM53C-209	ENST00000511595	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	DHCR24	Q15392	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PHF2	O75151	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CDKL5	O76039	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ITGAM	P11215	1152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CPE	P16870	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MPP3	Q13368	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	UGT8	Q16880	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TTC1	Q99614	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ENPP1	P22413	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PTPN7	P35236	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	NEMP1	O14524	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	AKR1B10	O60218	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ZEB2	O60315	1214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FDXR	P22570	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ID4	P47928	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	OCA2	Q04671	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	MED25	Q71SY5	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595		Q96MF0	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595		A0A1B0GTW7	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	BRINP1	O60477	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	C1QL1	O75973	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	CDK17	Q00537	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	SP140	Q13342	867 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FAM53C-209	ENST00000511595	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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