RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		14.77	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN1	O60635	241 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	AKAP5	P24588	427 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	AXL	P30530	894 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NPEPPS	P55786	919 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RING1	Q06587	406 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GRIK3	Q13003	919 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PTGDR	Q13258	359 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB33A	Q14088	237 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF149	Q8NC42	400 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	KLK14	Q9P0G3	267 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZBTB43	O43298	467 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SPINK2	P20155	84 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CCNE1	P24864	410 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CDC27	P30260	824 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GDI1	P31150	447 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	HOXC13	P31276	330 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	OR1D2	P34982	312 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PSMC5	P62195	406 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC51	Q96ER9	411 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	LHX6	Q9UPM6	363 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC27A2	O14975	620 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	KIF4A	O95239	1232 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GNA11	P29992	359 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXC1	Q12948	553 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TUSC3	Q13454	348 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PDXDC1	Q6P996	788 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	VIT	Q6UXI7	678 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RTL10	Q7L3V2	364 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	HACE1	Q8IYU2	909 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	LOXL4	Q96JB6	756 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	WASF3	Q9UPY6	502 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GIPC1	O14908	333 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ASAP2	O43150	1006 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	EPN2	O95208	641 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PTPN2	P17706	415 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PSMC3	P17980	439 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RAP1GAP	P47736	663 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	USP11	P51784	963 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05	4e-9	■□□□□ 9.4
FAM53C-208	ENST00000511276	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276		Q6ZS52	159 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	FERMT3	Q86UX7	667 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CEP170P1	Q96L14	293 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ASB16	Q96NS5	453 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PARP2	Q9UGN5	583 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	HOXA6	P31267	233 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RFC5	P40937	340 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	PTEN	P60484	403 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRC32	Q14392	662 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276		Q4G0T1	1027 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR44	Q5JSH3	913 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF43	Q68DV7	783 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	GATA6	Q92908	595 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	AKAP13	Q12802	2813 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF263	O14978	683 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	NPTXR	O95502	500 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FAM53C-208	ENST00000511276	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05

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